Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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