Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms