Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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ATP1A4Q13733 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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ATP1A4Q13733 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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ATP1A4Q13733 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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