Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms