Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms