Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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