Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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SCGB2A2Q13296 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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SCGB2A2Q13296 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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SCGB2A2Q13296 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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