Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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CALCOCO2Q13137 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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CALCOCO2Q13137 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CALCOCO2Q13137 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CALCOCO2Q13137 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CALCOCO2Q13137 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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