Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANK3Q12955 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms