Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms