Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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