Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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