Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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