Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms