Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms