Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms