Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FMODQ06828 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms