Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms