Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms