Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms