Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms