Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SH3BP2P78314 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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