Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HBBP68871 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms