Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms