Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBE2NP61088 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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