Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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