Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN5P54829 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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