Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms