Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB3P54284 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms