Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PIK3CBP42338 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PIK3CBP42338 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PIK3CBP42338 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PIK3CBP42338 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PIK3CBP42338 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PIK3CBP42338 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PIK3CBP42338 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PIK3CBP42338 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PIK3CBP42338 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PIK3CBP42338 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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