Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMPOP42166 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms