Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms