Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SOX11P35716 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOX11P35716 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms