Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms