Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA3P35244 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms