Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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