Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB2P29033 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB2P29033 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB2P29033 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms