Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms