Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
IL3RAP26951 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms