Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms