Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XPAP23025 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XPAP23025 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XPAP23025 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XPAP23025 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XPAP23025 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XPAP23025 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XPAP23025 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XPAP23025 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms