Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms