Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms