Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms