Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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