Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms