Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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