Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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