Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SFTPBP07988 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPBP07988 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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