Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSLP07711 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSLP07711 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms